5 lipca 2021 w Łasku w obecności I zastępcy dowódcy generalnego RSZ gen. broni pil. Jana Śliwki przekazał płk. pil. Tomasz Jatczak dowodzenie 32 Bazą Lotnictwa Taktycznego dla płk. pil. Piotra Ostroucha, po czym objął stanowisko służbowe zastępcy dowódcy 2 Skrzydła Lotnictwa Taktycznego w Poznaniu. 21 stycznia 2022 minister obrony narodowej Mariusz Błaszczak wręczył oficerom Wojska Polskiego, w tym płk. pil. Tomaszowi Jatczakowi nominacje na stanowisko służbowe dowódcy 2 Skrzydła Lotnictwa Taktycznego, z dniem objęcia stanowiska 1 lutego 2022. Jednocześnie był dowódcą Garnizonu Poznań.
10 listopada 2022 został awansowany na stopień generała brygady przez prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej Andrzeja Dudę. 13 października 2025 wicepremier i minister obrony narodowej, Władysław Kosiniak-Kamysz wyznaczył gen. bryg. pil. Tomasza Jatczaka na stanowisko Inspektora Sił Powietrznych w Dowództwie Generalnym RSZ, z dniem objęcia stanowiska 20 października 2025. Tomasz Jatczak posiada uprawnienia instruktora oraz pilota doświadczalnego na samolocie MiG-29, ma ponad 2500 godzin pilotując m.in.