Na początku 1651 rozpoczęto nowe przygotowania do walnej rozprawy z powstańcami Chmielnickiego. Powiększono armię niemal trzykrotnie, tworząc obok 65 starych jednostek 95 nowych i podnosząc stan liczebny wojska z 11758 do 32784 koni i porcji. Znaczne straty poniesione przez korpus hetmana Kalinowskiego w wiosennych walkach na Ukrainie i późniejsze w bitwie pod Beresteczkiem, spowodowały, że mimo utworzenia dalszych 10 jednostek regularna armia koronna w 1651 liczyła już tylko 28 585 koni i porcji. Powołana w kompucie w czwartym kwartale 1952 chorągiew pancerna koronna Jana Myśliszewskiego liczyła 100 koni.
W pierwszej połowie 1655 Rzeczpospolita przygotowywała się do odparcia szwedzkiej agresji. Sejmiki wojewódzkie, a także sejm nadzwyczajny uchwaliły podatki i nakazały zwiększenie liczebności sił zbrojnych. W drugim kwartale roku, w składzie komputu znajdowało się 86 chorągwi kozackich (pancernych) – w sumie 8039 koni. Jedną z nich była chorągiew Jana Myśliszewskiego licząca 35 koni
W pierwszych miesiącach 1656 chorągiew kozacka Jana Myśliszewskiego wzięła udział w wyprawie Stefana Czarneckiego przeciw wojskom szwedzkim w Sandomierskie. Liczyła wtedy 90 koni. W bitwie pod Gołębiem straciła 21 koni.