Najsłynniejszym dziełem jest kantata paschalna „Chad Gadya" (Jedno koźlątko), oparta na tekście i melodii dziecięcej piosenki śpiewanej podczas seder w święto Paschy. Składa się z czterech części: Allegro scherzando, Andantino oparte na motywach talmudycznych, Largo przedstawiające walkę anioła śmierci z szochetem oraz finał opisujący zwycięstwo prawości nad złem.
Inne kompozycje to m.in. kantata „Iz awek cum krig der melech" (A jak poszedł król na wojnę) do słów wiersza Marii Konopnickiej w tłumaczeniu Abrahama Reisena, orkiestrowa „Suita hebrajska" (Hebrew Suite), muzyka do dramatu Golem Halperna Leivicka (premiera w 1928 roku w cyrku przy ul. Ordynackiej) oraz pieśni choralne w języku jidysz.
Getto warszawskie Po rozpoczęciu niemieckiej okupacji Ajzensztadt rozważał ucieczkę do Związku Radzieckiego, ale za namową żony pozostał w Warszawie. W getcie rodzina zamieszkała przy ul. Ceglanej.
Nawet w panujących tam warunkach nie zaprzestał działalności artystycznej. W Teatrze Femina przy ul. Leszno założył orkiestrę symfoniczną, podczas koncertów której w pełni objawił się talent jego córki Marysi.