Holotyp to czaszka dorosłego samca zakonserwowana w alkoholu (sygnatura TISTR 688) ze zbiorów Tajlandzkiego Instytutu Badań Naukowych i Technologicznych w Bangkoku; okaz typowy zebrał 4 sierpnia 1973 tajlandzki ornitolog i teriolog Kitti Thonglongya.
Zalicza się on do kreowanego w 1865 roku rodzaju Megaerops, czyli bezogoniec, wraz z kilkoma innymi gatunkami, jak bezogoniec sundajski, bezogoniec jawajski czy dawny Megaerops wetmorei. Zwłaszcza z bezogońcem sundajskim mylono bezogońca indochińskiego. Wynika z tego trudność zaklasyfikowania do gatunku pewnych bezogońców z północno-wschodnich Indii, niegdyś uznawanych za bezogońce indochińskie, potem zaś zauważono, że przypominają bardziej bezogońca sundajskiego. Bezogoniec należy do plemienia Cynopterini, zasobnego w 14 gatunków, umieszczonych także w rodzajach Cynopterus (krótkonosek) i Ptenochirus (piżmolot). Wraz z drugim plemieniem Balionycterini, obejmującym 17 gatunków, tworzy ono podrodzinę Cynopterinae. Jest ona jedną z ośmiu podrodzin w rodzinie rudawkowatych (Pteropodidae), obejmującej w sumie 191 gatunków.
W obrębie tego gatunku nie wyróżnia się podgatunków.
Etymologia Megaerops: rodzaj Megaera ;