Potencjał wojskowy Po rozpadzie ZSRR liczebność wojsk rosyjskich w obwodzie królewieckim znacząco zmniejszono. Według danych z 1999 roku Kaliningradzki Rejon Obronny liczył około 25 tysięcy żołnierzy. W jego składzie znajdowały się wojska lądowe i brzegowe floty z 850 czołgami, 550 wieloprowadnicowymi wyrzutniami rakietowymi i 350 systemami artyleryjskimi, Flota Bałtycka z 99 okrętami różnych klas, w tym sześcioma okrętami podwodnymi, lotnictwo morskie z ponad 180 samolotami i śmigłowcami bojowymi oraz transportowymi, a także wojska obrony powietrznej z systemami S-300PS.
Według tygodnika „Kommiersant-Włast” w 2003 roku w skład Kaliningradzkiego Rejonu Specjalnego wchodziły między innymi: struktury dowodzenia i zabezpieczenia Floty Bałtyckiej w Królewcu, w tym sztab floty, zaplecze logistyczne, węzły łączności i punkty dowodzenia; jednostki rozpoznawcze Floty Bałtyckiej w Królewcu, Bałtyjsku i Zielenogradsku; zgrupowanie okrętów nawodnych, w tym brygada okrętów nawodnych, brygada kutrów rakietowych oraz jednostki remontowane i budowane; jednostki piechoty morskiej wraz z jednostkami desantowymi; lotnictwo morskie, jednostki obrony powietrznej i wojska brzegowe floty; baza morska w Bałtyjsku, obejmująca między innymi jednostki ochrony rejonu wodnego, trałowce, okręty ratownicze i zaplecze logistyczne; jednostki obrony