Dlatego w zastosowaniach wymagających bardzo wysokiej precyzji preferuje się bezpośrednie wejścia sprzętowe albo interfejsy, których opóźnienia są dobrze zmierzone i stabilne.
Dokładność i kalibracja Dokładność deklarowana przez źródło PPS nie jest tym samym, co dokładność zarejestrowana przez odbiornik. Odbiornik GPS może generować krawędź impulsu blisko granicy sekundy swojej skali czasu, ale kabel, układy pośredniczące i mechanizm przechwytywania zdarzenia wprowadzają własne opóźnienia. W pomiarach, w których liczą się nanosekundy lub dziesiątki nanosekund, opóźnienie toru PPS mierzy się i odejmuje od wyników albo traktuje jako składnik niepewności.
Stabilność PPS zależy też od jakości oscylatora lokalnego między kolejnymi impulsami. PPS dostarcza odniesienia dla granic sekund, ale zegar systemowy nadal musi płynnie odmierzać czas pomiędzy nimi. Oprogramowanie dyscyplinujące zegar, takie jak mechanizmy NTP współpracujące z PPS, wykorzystuje serię impulsów do ograniczania i jitteru, a nie tylko do jednorazowego ustawienia czasu.