Pod koniec 2025 roku spółka została wybrana przez ESA do roli głównego wykonawcy (ang. prime contractor) do fazy A misji Twardowski. Projekt zakłada umieszczenie satelity, opartego na platformie HyperSat na orbicie Księżyca. Współpraca przy misji sięga 2023 roku, kiedy Creotech Instruments S.A. pozyskał kontrakt do przygotowania Fazy 0/A.
W kwietniu 2025 roku zarząd podjął decyzję o reorganizacji struktury spółki poprzez wydzielenie dwóch segmentów działalności do odrębnych spółek. W maju zarejestrowano Creotech Geo P.S.A., zajmującą się rozwiązaniami w zakresie aplikacji dronowych i satelitarnych, a w szczególności systemów UTM (Unmanned Traffic Management). W czerwcu założono spółkę Creotech Quantum S.A., do której wydzielono segment technologii kwantowych. Proces podziału zakończył się 1 kwietnia 2026 roku wpisem do Krajowego Rejestru Sądowego. 17 kwietnia Creotech Quantum S.A. zadebiutowała na Giełdzie Papierów Wartościowych w Warszawie, jako samodzielna spółka.
W 2026 roku Creotech Instruments S.A. ogłosił strategię rozwoju do 2029 roku, zakładającą osiągnięcie pozycji czwartego największego integratora misji kosmicznych w Europie. Spółka planuje również rozszerzyć ofertę z mikrosatelitów o minisatelity oraz co najmniej czterokrotnie zwiększyć zdolności produkcyjne.