W kwietniu 1999 roku został skierowany na misje do Ekwadoru, do placówki w miejscowości Quinindé. W 2002 roku objął tam stanowisko dyrektora szkoły podstawowej dla ubogich dzieci św. Marii z Nazaretu, którą z czasem rozbudował do poziomu szkoły średniej (Colegio Sagrada Familia de Nazareth). W 2008 roku na własną prośbę zrezygnował z funkcji kierowniczych, chcąc w pełni poświęcić się bezpośredniej pracy wychowawczej, opiece duchowej, grze w teatr oraz katechizacji osieroconych i opuszczonych dzieci znajdujących się pod opieką misji.
Bohaterska śmierć W niedzielę 5 lutego 2012 roku brat Pedro Manuel udał się wraz z grupą podopiecznych i drugą opiekunką na plażę w pobliżu misji w Ekwadorze. Podczas kąpieli w morzu blisko brzegu utworzył się silny prąd wsteczny (cofający), który nagle zaczął wciągać siedmioro dzieci na pełne morze. Misjonarz bez wahania wskoczył do wody, wypowiadając słowa: „muszę uratować moje dzieci”. Salado Alba zdołał wyciągnąć z toni morskiej jedno po drugim pięcioro podopiecznych. Po uratowaniu ostatnich dwóch chłopców i bezpiecznym wypchnięciu ich na brzeg, całkowicie wycieńczony fizycznie misjonarz zmarł z wysiłku na plaży.