Po I wojnie światowej południowo-zachodnia część powiatu – mniejsza, aczkolwiek z Sejnami – weszła w skład II Rzeczypospolitej jako powiat sejneński, natomiast większa północno-wschodnia część przypadła odrodzonej Republice Litewskiej, gdzie utworzono odrębny powiat sejneński z siedzibą władz w Łoździejach (lit. Lazdijai); ponadto wschodnie gminy powiatu sejneńskiego (Metele, Mirosław, Sereje, KudranyGminę Kudrany przekształcono głównie w gminę Liszkowo.) włączono do powiatu olickiegoLietuvos apgyventos vietos: pirmojo visuotinojo Lietuvos gyventojų 1923 m. surašymo duomenys. – Kaunas, Centralinis Statistikos Biuras, 1925..
Polski powiat sejneński zniesiono 1 stycznia 1925, włączając go do powiatu suwalskiego. Tak więc w latach 1919–1924 istaniały dwa odrębne powiaty o nazwie sejneński – polski i litewski. Litewski powiat sejneński przetrwał czasów II wojny światowej, kiedy to został przekształcony w powiat łoździejski. Oznacza to, że w okresie 1925–1941 jedynym istniejącym powiatem sejneńskim była jednostka nie obejmująca SejnSeinų apskritis. Tarybų Lietuvos enciklopedija, T. 3 (Masaitis-Simno).