Do 1940 roku zakopała część próbek skał w namorzynach, aby po kilku latach porównać je z próbkami kontrolnymi przechowywanymi w laboratorium urządzonym we własnym domu. W czasie pobytu w Singapurze para doczekała się trojga dzieci: Williama w 1937 roku, Mary w 1939 i Bernice w 1941.
Praca w czasie wojny W latach 1940–1941 Alexander jako oficer wywiadu marynarki (Naval Intelligence Service) zajmowała się radionamierzaniem w bazie morskiej w Singapurze. Według jej córki, Mary Harris, pracę wojenną w bazie rozpoczęła już w 1938 roku. Brytyjska Admiralicja tworzyła wówczas sieć wysokoczęstotliwościowych stacji radionamierzania dalekiego zasięgu, której centrum kontroli był Singapur. Singapur utrzymywał szczególnie bliskie związki z Nową Zelandią, krajem zaawansowanym w technice radiowej.
W styczniu 1942 roku Alexander otrzymała rozkaz przewiezienia dzieci w bezpieczne miejsce, do rodziny męża w Nowej Zelandii, i powrotu do bazy ze specjalistycznym sprzętem produkowanym w Sydney. Wraz z dziećmi opuściła Singapur wodnosamolotem Short S.23 „Ceres”. Po upadku Singapuru 15 lutego pozostała w Nowej Zelandii bez dochodów i bez wiadomości o mężu, a następnie błędnie poinformowano ją, że zginął.