Generalnie rudawkowate są owocożercami, w przeciwieństwie do wielu innych owadożernych nietoperzy. Także owocnik karłowaty żywi się głównie owocami, jednakże względnie krótki pysk z małymi kłami wskazuje na spożycie również kwiatów. Podobnie czyni także owocnik borneański.
Zagrożenia i ochrona IUCN uznaje owocnika karłowatego za gatunek najmniejszej troski. Organizacja po raz pierwszy wypowiedziała się o owocniku karłowatym w 1992, uznając jego status za nieokreślony, jeszcze nie odróżniając obu gatunków owocnika. Podobnie oceniono go 2 lata później, natomiast w 1996 status doprecyzowano jako niższego ryzyka / bliski zagrożenia. W 2008 i 2016 status określono jako najmniejszej troski, co powtórzono w 2023. W uzasadnieniu IUCN podaje szeroki zasięg występowania zwierzęcia. Przyznaje, że całkowita liczebność spada, ale tempo spadku nie wydaje się duże.
Całkowita liczebność maleje, aczkolwiek nie ulega znacznym fluktuacjom. Podobnie dzieje się z zasięgiem występowania zwierzęcia.
Głównym zagrożeniem jest wylesianie, stoją za nim rozwój rolnictwa, produkcji energii, turystyki, zmiany klimatyczne.
Przypisy 22. Common Pygmy Fruit Bat, s. 74, w: