Kagan uczestniczyła w pracach zespołów doradczych związanych z amerykańskimi operacjami w Iraku i Afganistanie. W październiku 2008 i 2009 brała udział w pracach Joint Campaign Plan Assessment Team dla Multi-National Force–Iraq i U.S. Mission–Iraq. W styczniu 2009 uczestniczyła w przeglądzie strategicznym CENTCOM, a w czerwcu i lipcu 2009 była członkinią zespołu oceny strategicznej generała Stanleya McChrystala w Kabulu.
W latach 2010–2011 przebywała w Afganistanie jako cywilna doradczyni dowództwa ISAF, pracując przy projektach specjalnych dla generałów Davida Petraeusa i Johna Allena. W 2012 „The Washington Post” opisał jej i Fredericka Kagana współpracę z Petraeusem jako nietypowy model dostępu cywilnych analityków do dowództwa i informacji wojskowych.
W latach 2013–2016 była współpracowniczką Working Group on the Role of Military History in Contemporary Conflict w Hoover Institution.
Publikacje Jest autorką książek The Eye of Command oraz The Surge: A Military History, a także redaktorką tomu The Imperial Moment. Publikowała również teksty m.in.