Fauna thumb|Ułar kaukaski w Karaczajo-Czerkiesji (2023) Na obszarze Tuszeckiego Parku Narodowego występuje ok. 180 gatunków zwierząt, w tym 60 gatunków ssaków, ok. 120 gatunków ptaków, 3 gatunki gadów, 6 gatunków płazów i jeden gatunek ryb.
Ssaki na terenie parku reprezentowane są m.in. przez sarny (Capreolus capreolus), niedźwiedzie brunatne (Ursus arctos), rysie (Lynx lynx), lisy (Vulpes vulpes), wilki (Canis lupus), zające (Lepus europaeus) oraz zachodzące z sąsiedniego Dagestanu dziki euroazjatyckie (Sus scrofa) oraz nietoperze, takie jak nocek rudy (Myotis daubentonii) i mopek zachodni (Barbastella barbastellus). Strome, skaliste zbocza górskie są miejscem występowania koziorożca walcorogiego (Capra cylindricornis), kozicy (Rupicapra rupicapra) oraz kozy bezoarowej (Capra aegagrus), której zagraża nielegalny odstrzał, Tuszetia zaś jest ostatnim w Gruzji obszarem jej występowania.
Występują tu również gatunki endemiczne, m.in. (Sorex raddei), (Sorex volnuchini), (Chionomys gud), (Chionomys roberti), (Microtus majori) i (Microtus daghestanicus).