Wybór miejsca dla pomnika podyktowany został obecnością tradycji maryjnej w Konotopiu. W bezpośrednim sąsiedztwie usytuowane jest sanktuarium poświęcone Matce Bożej Bolesnej. W 1885 roku lokalny ewangelik sfinansował w tym miejscu obiekt kultu z drewnianą pietą w podzięce za „cudowne” uzdrowienie córki. Niewielka rzeźba zyskała sławę, co zaowocowało inicjatywą budowy większej świątyni przez ks. Wojciecha Wolskiego w latach 1937–1938. Choć niemieccy okupanci zniszczyli obiekty sakralne pod koniec 1939 roku, figura została ocalona dzięki potajemnemu ukryciu.
Pomnik Matki Bożej Miłosiernej w Konotopiu został odsłonięty i poświęcony przez biskupa diecezji włocławskiej Krzysztofa Wętkowskiego w dniu Święta Wniebowzięcia Najświętszej Maryi Panny, 15 sierpnia 2026 roku. W uroczystościach wziął udział m.in. Lech Wałęsa. Uroczystość zyskała oprawę dzięki asyście powietrznej. Nad miejsce wydarzenia skierowano parę helikopterów, które wielokrotnie okrążyły monument, a ich załogi rozsypały płatki kwiatów róż. Konstrukcja stała się najwyższym pomnikiem maryjnym w Europie oraz drugim co do wielkości na świecie.
mały|Pomnik w trakcie budowy (lipiec 2026)