Działania te jednak nie wystarczyły. Wieczorem 27 września grupa czamskich milicjantów albańskich przeszukała niemal każdy dom w Paramythii. Oficer milicji czamskiej, Mazar Dino, dysponując listą nazwisk, aresztował 53 mieszkańców i zamknął ich w budynku szkoły podstawowej, gdzie oczekiwali na egzekucję.
Egzekucja więźniów Bracia Mazar i Nuri Dino, którzy zaaranżowali te zabójstwa, by pozbyć się przywódców i przedstawicieli lokalnej greckiej inteligencji, wiedzieli o zamiarach Dorotheosa i podjęli natychmiastowe działania. O północy 29 września więźniów przewieziono na miejsce egzekucji na obrzeżach miasta. Jednakże czterech więźniów zwolniono. Według niemieckiego sierżanta Helmuta Götty, który wchodził w skład plutonu egzekucyjnego:
Według powojennych zeznań Götty w składzie plutonu egzekucyjnego znajdowali się Albańczycy z grupy Czamów. Choć pojawiały się doniesienia, że zwłoki okradziono z biżuterii i pieniędzy, Götte temu zaprzeczył. Według innego Niemca, członka plutonu egzekucyjnego, po rozstrzelaniach krewnym nakazano natychmiastowy pochówek ciał.
Ofiary wywodziły się z różnych środowisk, lecz większość z nich stanowiły znaczące postacie greckiej społeczności Paramythii.