Po wybuchu wojny 3 września ewakuowała się z dziećmi z Warszawy do Suchej i dalej na wschód, ale po inwazji ZSRR i osadzeniu męża przez Niemców w obozie jenieckim po pierwszej bitwie pod Tomaszowem Lubelskim 20 września powróciła do Warszawy i zamieszkała na Powiślu przy ul. Idźkowskiego 4. Zaangażowała się w konspiracyjną działalność publicystyczną, propagandową i charytatywną, okazując niechęć wobec głównonurtowych inicjatyw politycznych. Od końca października 1939 przez około sześć miesięcy gościła w mieszkaniu przy Idźkowskiego dobrze znanego sobie Aleksandra Kamińskiego, który 5 listopada 1939 rozpoczął wydawanie „Biuletynu Informacyjnego”, pisma Okręgu Warszawskiego Służby Zwycięstwu Polski i następnie Związku Walki Zbrojnej, z czasem oficjalnego organu prasowego Polskiego Państwa Podziemnego. Wiosną 1940 powstało Biuro Informacji i Propagandy, któremu podporządkowany został „Biuletyn”, a Kamiński przeniósł się na Żoliborz i związki Kossak z pismem uległy zerwaniu do 1944.