Zwrot w życiorysie – korupcja i współpraca z NKWD 6 września 1927 Wojskowy Sąd Okręgowy Nr I w Warszawie pod przewodnictwem gen. bryg. Bronisława Sikorskiego skazał go za nadużycia finansowe przy dostawach dla armii dokonywanych przez przedsiębiorstwo Protekta (maski przeciwgazowe) na karę 5 lat ciężkiego więzienia i karę dodatkową na czci – wydalenia z wojska. W składzie sędziowskim znaleźli się także generałowie: Stanisław Wróblewski, Wiktor Thommée, Michał Tokarzewski-Karaszewicz, a także kontradmirał Michał Borowski. Wśród niespełna stu powołanych świadków byli między innymi generałowie Kazimierz Pławski i Władysław Sikorski. Według sądu Żymierski „użył świadomie swego stanowiska służbowego na szkodę interesu majątkowego Skarbu Państwa” w wysokości 150 tys. dolarów. Ze względu na celowe wstrzymanie dostawy gaśnic w ustawionym przetargu i pozbawienie w ten sposób budynków wojskowych ochrony przeciwpożarowej sąd skazał go na karę pięciu lat ciężkiego więzienia.