Przedstawiciele obu sztabów otrzymali w prezencie po jednej polskiej kopii maszyny Enigma, które dalej zostały przekazane do Paryża i do Londynu. W grudniu 1939 r. Brytyjczycy wykonali dwa komplety płach Zygalskiego, jeden komplet został wysłany do tajnego ośrodka dekryptażu PC Bruno, znajdującego się w miejscowości Gretz-Armainvillers pod Paryżem.
Choć w swojej tajnej pracy Zygalski był związany tajemnicą, tuż przed wybuchem wojny ostrzegł rodzinę, mieszkającą w Poznaniu przed nadciągającym niebezpieczeństwem. Pod koniec sierpnia 1939 r., gdy opuszczał Poznań i żegnał się z rodziną, szepnął do męża swojej siostry Moniki: „Wybuchnie wojna światowa. Opiekuj się moją mamą i siostrą”.
II wojna światowa Ewakuacja z Polski 1 września 1939 r. wybuchła wojna. Już po kilku dniach niemiecka armia była pod Warszawą. Zamiast pracować trójka kryptologów musiała ewakuować się z Polski. 5 września zaczęły się przygotowania do ewakuacji: niszczenie wszystkich dokumentów i sprzętów używanych do odczytywania wiadomości przesyłanych przez Niemcy za pomocą maszyny Enigmy, następnie ośrodek w Pyrach został częściowo wysadzony w obawie, że tajne informacje wpadną w ręce oddziałów Wermachtu.