Wymieniona w dokumencie zapisanym po łacinie z 1303 pod nazwą Sanczkowicze, 1388 Sanczkowo, 1393 Sanczkovicze, 1395 Sanczcowicze, 1406 Sanczcouicze, 1408 Sanczcowo, 1439 Saczekowo, 1498 Szaczkowo, 1508 Minor Sanczcowo, 1508 Szanczkowo, 1547 Sanczkowko, Sanczkowo Maius.
Tereny w pobliżu których leżała wieś zasiedlone jednak były wcześniej niż podają to archiwalne zapisy. Na wzgórzu obok łąki, na miejscu jeziora, archeolodzy odkryli niedatowane cmentarzysko, a w nim dwa groby szkieletowe. W jednym z nich znaleziono „pałasz” wykonany z miedzi. Znaleziska znajdują się w archiwum Muzeum Archeologicznego w Poznaniu.
Miejscowość miała mieszaną własność. Początkowo była częścią królewszczyzny czyli należała do dziedzictwa królów polskich. Później stała się majętnością duchowną opactwa cystersów w Wieleniu, a następnie wsią szlachecką należącą do lokalnej szlachty wielkopolskiej z rodu Sączkowskich, którzy od nazwy wsi przyjęli odmiejscowe nazwisko. Później poprzez wykup lub wymianę należała także do innych rodów szlachty wielkopolskiej: Kluczewskich, Wilkowskich. W 1449 należała do powiatu kościańskiego Korony Królestwa Polskiego. W 1439 należała w parafii św. Andrzeja w Przemęcie.