Interakcje międzygatunkowe Często występuje w zbiorowiskach nymfeidów, których jest typowym przedstawicielem, z innymi roślinami wodnymi, szczególnie grążelem żółtym – w odróżnieniu od niego jednak wnika też w szuwary, gdzie z innymi roślinami tworzy zespoły roślin wodno-szuwarowych. Jest gatunkiem charakterystycznym dla zespołu roślinności Nupharo-Nymphaeetum albae i związku Nymphaeion.
Grzybienie są rośliną pokarmową wielu zwierząt. Na liściach żerują larwy i owady dorosłe chrząszczy – szarynki grzybieniówki Galerucella nymphaeae, rzęsielnicy grzybieniówki Donacia crassipes, Mononychus punctumalbum. Liśćmi i kwiatami żywią się gąsienice molika nymfy świtezianki Nymphula nymphaeata. Na gatunku tym żerują też mszyce Rhopalosiphum nymphaeae, larwy muchówek – Endochironomus tendens, Cricotopus ornatus i Cricotopus trifasciatus, błotniarka stawowa Lymnaea stagnalis, skorupiaki – rak błotny Astacus leptodactylus i Cambaroides dauricus. Spośród kręgowców grzybienie zjadają: desman ukraiński Desmana moschata, karczownik ziemnowodny Arvicola amphibius, piżmak amerykański Ondatra zibethicus i nutria amerykańska Myocastor coypus oraz liczne kaczkowate.
Systematyka i zmienność thumb|Kultywar o kwiatach różowych thumb|Kultywar o kwiatach różowych