Jednak przyszłość tych wydań okazała się niepewna. Już w 2009 roku pojawiły się informacje o możliwym zakończeniu projektu. Ostatecznie, decyzją ówczesnego redaktora naczelnego Grzegorza Jankowskiego, projekt został zamknięty w 2009 roku, zaledwie rok po jego rozpoczęciu. Krytyka W 2004 i 2005 Stowarzyszenie Dziennikarzy Polskich przyznało „Faktowi” tytuł „Hieny Roku” za wyróżnienie się szczególną nierzetelnością i lekceważeniem zasad etyki dziennikarskiej. Przyznanie tej „nagrody” Faktowi zagwarantował krzykliwy, często obraźliwy styl artykułów oraz powszechne celowe wprowadzanie czytelników w błąd.
„Fakt” wielokrotnie oskarżany był w innych mediach o podawanie nieprawdy i tworzenie materiałów fikcyjnych. Słynnym przykładem jest seria artykułów o rzekomym wielorybie płynącym Wisłą.
Artykuły w dzienniku są często oparte na niesprawdzonych spekulacjach. Przykładem jest artykuł z pierwszej strony „Faktu” o rzekomym nadużyciu ministra edukacji Romana Giertycha pt. Dał rodzicom rządowe auto. Sprawa zakończyła się przeprosinami redaktora naczelnego Faktu.