W 1853 r. rozpoczęto budowę nowego murowanego kościoła w Chochołowie według projektu Feliksa Księżarskiego. Inicjatorem przedsięwzięcia był pochodzący z Chochołowa ksiądz Wojciech Blaszyński, który będąc proboszczem w Sidzinie cały czas kierował pracami budowy kościoła oraz zabezpieczał potrzebne środki materialne. Maria Steczkowska, wracająca w 1857 r. z Zakopanego do Nowego Targu, w wydanych rok później „Obrazkach z podróży do Tatrów i Pienin” wspominała: Nieco wbok ubogiego tutejszego kościółka stawiają nowy z kamienia, podobno na wzór kościoła św. Katarzyny w Krakowie; lecz rozumie się, że bez porównania mniejszy. Przeszłego lata był już parę łokci nad ziemię wzniesiony.
Budowę chochołowskiego kościoła ukończono w 1873 r., już po śmierci ks. Blaszyńskiego. Konsekracji kościoła dokonał ks. kardynał Albin Dunajewski w dniu 29 lipca 1886 r.
W Chochołowie do 21 grudnia 2007 r. funkcjonowało polsko-słowackie przejście graniczne Chochołów – Suchá Hora.
W październiku 2018 r. w miejscowości zostało otwarte Centrum Dziedzictwa Przyrodniczego – Muzeum Torfowisk. Mieści się ono w zabytkowym, drewnianym budynku z przełomu XVIII i XIX w., w którym poprzednio mieścił się Ośrodek Zdrowia.