Rozgrywka Mechanika nie uległa wielkim zmianom w stosunku do części podstawowej. Zostały dodane liczne usprawnienia (nowe badania, technologie, nieco zmienione drzewa rozwoju ras oraz inne właściwości niektórych jednostek). Do gry dodana została cała nowa armia – Gwardia Imperialna – która wymaga zupełnie innego stylu gry. Gwardia Imperialna to armia złożona z licznych poborowych z wielu planet kosmosu. Dysponuje słabymi jednostkami podstawowymi, ale ma potężne wsparcie ogniowe w postaci artylerii typu „Basilisk”. Posiada też najsilniejszy pojazd pancerny w całym uniwersum gry – superciężki czołg typu „Baneblade”. Gwardia Imperialna dysponuje też jednym z najlepszych czołgów szturmowych – typem „Leman Russ”. Morale podstawowej jednostki Gwardii Imperialnej – Gwardzistów – jest bardzo niskie, dlatego należy je wspomagać jednostkami Komisarzy, Psioników oraz Kapłanów.
Pozostałe strony konfliktu otrzymały nowe jednostki: Chaos – Berserkerów Khorna, potężną jednostkę do walki wręcz. Orki – Megapancernych Burszujów, elitarny oddział do walki wręcz. Kosmiczni Marines – Kapelana, potężnego kapitana posiadającego aurę leczącą pobliskich sprzymierzeńców. Eldarzy – Ogniste Smoki, jednostki piechoty wyspecjalizowane w niszczeniu pojazdów oraz budynków.