W latach 70. XX wieku Magdalenka była prestiżowym miejscem, w którym swe dacze budowali przedstawiciele najwyższych władz PRL. Domy wypoczynkowe w Magdalence posiadali m.in. wicepremier Franciszek Szlachcic, minister spraw wewnętrznych Stanisław Kowalczyk, wicepremier Franciszek Kaim, Marszałek Polski Michał Żymierski, gen. Roman Paszkowski, gen. Władysław Polański, gen. Józef Urbanowicz, gen. Bronisław Kuriata, minister gen. Mieczysław Moczar, minister Waldemar Kozłowski, gwiazda polskiej sceny Violetta Villas i wielu innych.
W latach 1975–1998 miejscowość administracyjnie należała do województwa warszawskiego.
W Magdalence znajduje się ośrodek rządowy, gdzie w roku 1988 i 1989, w okresie poprzedzającym rozmowy Okrągłego Stołu toczyły się rokowania między stroną rządową, której przewodniczył Czesław Kiszczak a stroną „solidarnościową”, której przewodził Lech Wałęsa.
W nocy z 5 na 6 marca 2003 roku w Magdalence doszło do próby zatrzymania dwóch mężczyzn podejrzanych o zabójstwo policjanta. Podejrzani zabarykadowali się w jednym z domów, a działkę zaminowali. W wyniku całonocnego oblężenia zginęło dwóch funkcjonariuszy, a kilkunastu odniosło obrażenia.