Z ważniejszych gatunków ptaków, można wymienić: myszołowa, kobuza, krogulca, puszczyka, dzięcioła zielonego i dzięcioła czarnego, grubodzioba, krzyżodzioba, gila i inne. Z płazów i gadów m.in. rzekotkę drzewną, padalca i zaskrońca. Istotnym problemem Lasu Kabackiego jest jednak antropopresja - czyli presja społeczeństwa na obszary zielone, objawiająca się płoszeniem dziko żyjących zwierząt. Dużym zagrożeniem dla zwierząt są także psy biegające po lesie.
W 2017, na podstawie przyjętego w 2016 planu ochrony rezerwatu, wprowadzono zakaz wprowadzania na teren Lasu Kabackiego psów. Plan wywołał także kontrowersje w zakresie przebudowy drzewostanu, która przeprowadzana jest przede wszystkim przy użyciu rębni częściowych i gniazdowych. W wyniku tych prac zmniejszył się udział sosny pospolitej na rzecz udziału gatunków liściastych, które mają być lepiej dostosowane do siedliska rezerwatu.