Systematyka thumb|Centuria pospolita thumb|Goryczka żółta thumb|Gentiana pannonica thumb|Eustoma exaltatum Na podstawie analiz chemizmu i badań molekularnych DNA stwierdzono przynależność do tej rodziny kilku rodzajów roślin drzewiastych tradycyjnie wcześniej zaliczanych do loganiowatych (rodzaje: Anthocleista, Fagraea, Potalia). Podobnie na podstawie cech związanych z chemizmem, ustalono, że zaliczany tu dawniej rodzaj Emblingia w istocie należy do kapustowców Brassicales, w obrębie których tworzy monotypową rodzinę Emblingiaceae. Należące do rodziny rodzaje myko-heterotroficzne (Voyria, Voyriella, Sabaea, Bartonia, Obolaria, Cotylanthera) nie są ze sobą blisko spokrewnione – zdolność do mykotrofizmu wyewoluowała kilkukrotnie w obrębie rodziny. W rodzajach Exochaenium i Exacum występują zarówno gatunki zielone jak i bezzieleniowe.
Pozycja systematyczna według APweb (aktualizowany system APG IV z 2016) Rodzina siostrzana w stosunku do toinowatych Apocynaceae w obrębie rzędu goryczkowców (Gentianales) z grupy astrowych (okrytonasienne).
Podział rodziny na plemiona i rodzaje thumb|Obolaria virginica thumb|Voyria caerulea Plemię Chironieae Endlicher
Plemię Exaceae Colla
Plemię Gentianeae Colla
Plemię Helieae Gilg