Od XV wieku Kłoda była siedzibą folwarku stanowiącego gospodarcze zaplecze zamku w Rydzynie. Ok. 1504 bracia Rydzyński zapisali czynsz 10 grzywien z Rydzyny, jej przedmieścia oraz wieś Kłoda kapitule poznańskiej.
W 1510 pleban z Rydzyny otrzymywał dziesięcinę z folwarku w Kłodzie oraz 3 grosze od łana mesznego z pola zwanego Wenecja, posiadał on również we wschodniej części folwark Zbytki. Folwark kłodzki liczył wówczas 10 i pół łanów osadzonych. Podczas podziału dóbr rydzyńskich w 1514 Kłoda, Tarnowa, Gorzyce i Gorzyczki, połowa Jarogniewic oraz połowa Rydzyny wraz z zamkiem stały się własnością Piotra Rydzyńskiego. Pięć lat później we wsi wybudowano pierwszy kościół, była to świątynia z pruskiego muru i otrzymała wezwanie Narodzenia Najświętszej Marii Panny. W 1519 właścicielami we wsi byli Piotr oraz Mikołaj Rydzyńscy. W 1530 wieś miała 8 łanów osiadłych oraz wiatrak. W 1563 we wsi pobrano podatki od 15 i 3/4 łana, 6 komorników, rzemieślnika oraz dwóch wiatraków - dziedzicznego oraz dorocznego. W 1564 w Kłodzie odnotowano 13,5 łana. W 1580 było 14 łanów osadzonych, 2 kwarty roli, 11 zagrodników, we wsi mieszkało 6 komorników, 2 rzemieślników, 2 owczarzy hodujących 29 owiec, pracowały 3 wiatraki dziedziczne oraz jeden doroczny