– dowódca drugiej jednostki Shinsengumi, oddziału pełniącego funkcje policyjne w Kioto w schyłkowym okresie siogunatu Tokugawów.
W dzieciństwie Shinpachi nosił imię Eikichi lub Eiji.
Urodził się 11 maja 1839 w "kami-yashiki" (górnej rezydencji) klanu Matsumae w Edo (każdy daimyō utrzymywał w Edo trzy rezydencje: górną, średnią i niską; było to bardzo duże obciążenie finansowe, redukując fundusze mogące potencjalnie być przeznaczone na bunt; nie działało to w przypadku klanów otrzymujących nadwyżki z handlu, jak Chōshū i Satsuma). Ojciec Shinpachiego, Kanji Nagakura, był na służbie klanu Matsumae, z pensją wynoszącą 150 koku (miara ryżu). Był prawdziwym produktem okresu Edo, częścią subkultury samurajów spędzających całe swoje życie w Edo, pozostających jednocześnie wasalami domeny, której nigdy nie widzieli.
Ojciec Shinpachiego używał do zapisu nazwiska znaku "naga" oznaczającego "długi" (長), ale Shinpachi używał do tego znaku "naga" ze słowa "wieczność" (永).