Boehner pokonał niespodziewanie w wyborach Roya Blunta i Johna Shadegga.
W styczniu 2011 został spikerem Izby Reprezentantów – dzięki zwycięstwu republikanów w wyborach.
25 września 2015 ogłosił, że wraz z końcem października przestanie być kongresmenem, a więc przestanie być także spikerem Izby Reprezentantów. Boehner właściwie od samego początku swojego pobytu na tym stanowisku zmagał się z niechęcią najbardziej konserwatywnego skrzydła Partii Republikańskiej, które zarzucało mu zbytnią uległość względem prezydenta Baracka Obamy i Demokratów. Planowane było głosowanie dotyczące odwołania Boehnera z zajmowanej funkcji i choć wątpliwe, by starczyło głosów do jego obalenia, spiker stwierdził, że takie głosowanie wyrządziłoby szkodę instytucji spikera i Partii Republikańskiej. Ponadto Boehner ujawnił, że już od pewnego czasu nosił się z zamiarem opuszczenia polityki. Co ciekawe spiker, gorliwy katolik, ogłosił swoją rezygnację zaledwie dzień po wizycie papieża Franciszka w Kongresie.
Żonaty (żona Debbie), ma dwie córki (Lindsay, Tricia).