W 1362 roku miasto zostało na krótko zdobyte podczas Powstania Czerwonych Turbanów. Pod koniec XIV wieku cesarz Hongwu, pierwszy z dynastii Ming, wybudował dla swojego syna pałac, którego mury o wysokości 5 metrów miały długość 4,5 km. Pałac został zniszczony podczas wojen w okresie upadku dynastii Ming w połowie XVII wieku. Po dwuletniej okupacji miasta w latach 1644-1646, w wyniku masakr dokonanych przez wojska Zhanga Xianzhonga oraz późniejszych działań wojennych, Chengdu niemal całkowicie się wyludniło. W 1696 roku powołano w mieście dzisiejszą diecezję rzymskokatolicką.

XVIII - XX wiek thumb|Pałac królewski na początku XX wieku (nieistniejący obecnie) Po tragicznych wydarzeniach z połowy XVII wieku w wyniku których prowincja utraciła około 75% populacji, przez dziesięciolecia tereny były zasiedlane przez ludność z sąsiednich prowincji. Ponownie rozwinął się przemysł związany z produkcją brokatu, pod koniec panowania dynastii Qing w mieście działało ponad 2000 prywatnych warsztatów posiadających około 10 tysięcy krosień. Równina Chengdu słynęła również z uprawy wysokiej jakości tytoniu.