W latach 2002–2007 była w małżeństwie z Kazuakim Kiriyą, japońskim reżyserem i producentem. Wyreżyserował kilka jej wideo klipów: Final Distance, Traveling, Hikari, Sakura Drops, Deep River, Dareka no Negai ga Kanau Koro, You Make Me Want to Be a Man, Be My Last i Passion. Kiriya i Utada rozwiedli się w 2007 roku po czterech i pół latach małżeństwa. W latach 2014–2018 jej mężem był Włoch Francesco Calianno. W 2015 roku para doczekała się syna, w 2018 nastąpił rozwód. W 2021 podczas livestreamu Utada dokonała coming outu jako osoba niebinarna, preferująca neutralne formy językowe (jak anglojęzyczny prefiks .).
Dyskografia
Albumy Japońskojęzyczne albumy studyjne First Love (1999) Distance (2001) Deep River (2002) Ultra Blue (2006) Heart Station (2008) Fantôme (2016) Hatsukoi (2018)
Anglojęzyczne albumy studyjne Precious (jako Cubic U) (1998) Exodus (2004) This Is the One (2009)
Single Close to You (1997) Automatic / time will tell (1998) Movin' on without you (1999) First Love (1999) Addicted to You (1999) Wait & See ~Risk~ (lub Wait & See ~リスク~; 2000) For You / Time Limit (lub For You / タイム・リミット; 2000) Can You Keep a Secret?