Jej głównymi zadaniami było zaopatrywanie jednostek Marynarki Wojennej w sprzęt techniczno-okrętowy, ratowniczy, w uzbrojenie, urządzenia techniczne oraz materiały eksploatacyjne. W jednostce przeprowadzało się naprawy i legalizacje sprzętu dla potrzeb Marynarki Wojennej. Jednostka stacjonowała w kilku kompleksach wojskowych w Trójmieście. Od roku 1993 patronem Składnicy jest kontradmirał Xawery Czernicki. Od 2007 roku Centralna Składnica Marynarki Wojennej podporządkowana była Szefowi Inspektoratu Wsparcia Sił Zbrojnych, zaś organizacyjnie Dowódcy Pomorskiego Okręgu Wojskowego.
W dniu 31 maja 2011 roku uroczystym podpisaniem protokołów przekazano siły i środki Centralnej Składnicy Marynarki Wojennej na potrzeby nowo tworzonego Składu Gdynia. Swoje podpisy pod dokumentami złożyli: Komendant 1 Regionalnej Bazy Logistycznej płk. Adam Polowy i Komendant Centralnej Składnicy MW kmdr por. Krzysztof Szornak.
Zgodnie z decyzją Ministra Obrony Narodowej z dnia 9 marca z końcem 2011 roku CSMW uległa rozformowaniu. Natomiast od 1 lipca 2011 na bazie sił i środków Składnicy działalność rozpoczął Skład Gdynia w strukturach 1RBLog w Wałczu.
Skład Gdynia realizuje zadania związane z logistycznym zabezpieczeniem w sprzęt i uzbrojeniem morskim jednostek Marynarki Wojennej. Kierownikiem Składu Gdynia jest kmdr ppor.