11 maja 1990, dzień po rozwiązaniu Służby Bezpieczeństwa zarządzeniem ministra spraw wewnętrznych nr 043/90, komisja (bez udziału Holzera) przekazała swoje zalecenia z 18 kwietnia ministrowi Kiszczakowi jako „wskazane w celu zabezpieczenia materiałów archiwalnych” MSW, a także ministrowi Samsonowiczowi i wiceministrowi Kozłowskiemu. Donosiła zarazem, że „po otrzymaniu z Centralnego Archiwum MSW roboczego projektu nowelizacji resortowego wykazu akt rozpoczęła przeprowadzanie ekspertyzy dokumentacji znajdującej się w Ministerstwie”. Tego samego dnia Kiszczak nakazał zapoznać kierownictwo MSW z przesłanymi propozycjami, co wykonał gen. Stefan Stochaj przesyłając pismo do wiceministra Kozłowskiego, gen. Henryka Dankowskiego, gen. Zbigniewa Pudysza, płk. Leszka Lamparskiego, gen. Zdzisława Sarewicza, płk. Zbigniewa Gedego i płk. Jerzego Karpacza. Na postulaty komisji odpowiedział 25 maja komendant główny Policji Lamparski, który zgłosił jedno zastrzeżenie, domagając się wydzielenia dokumentacji spraw kryminalnych do oceny pojedynczego członka zakładanych komisji archiwalnych i motywując to zabezpieczeniem współpracowników Policji przed dekonspiracją i zemstą ze strony środowisk przestępczych.