Struktura organizacyjna ministerstwa przedstawiała się w tych latach następująco (maj 1953):
Gabinet ministra minister – gen.bryg Stanisław Radkiewicz wiceminister – gen. bryg. Roman Romkowski wiceminister – gen. bryg Mieczysław Mietkowski wiceminister – gen. bryg. Konrad Świetlik Inspektorat ministra (inspekcje zalecane przez ministra) – st.Inspektorzy płk-cy Antoni Pułda / płk Zbigniew Paszkowski Departament I (kontrwywiad) – dyr./płk Stefan Antosiewicz Departament II (technika operacyjna, perlustracja korespondencji oraz ewidencji) – dyr./ppłk Michał Taboryski Departament III (walka z podziemiem zbrojnym) – kier./dyr./płk Józef Czaplicki / Leon Andrzejewski Departament IV (ochrona gospodarki narodowej przed wrogą działalnością) – dyr./płk Józef Kratko /ppłk Bolesław Galczewski Departament V (społeczno-polityczny) – dyr./płk Julia Brystiger Departament VI (więziennictwa) – dyr./komisarz I stopnia Hipolit Duliasz Departament VII (wywiad zagraniczny) – dyr./ppk Witold Sienkiewicz Departament VIII (komunikacyjny) – dyr./mjr Czesław Radziukiewicz Departament IX (ochrona przemysłu ciężkiego i specjalnego) – dyr./ppłk Stanisław Wolański Departament X (walka z tzw.