21 września „Komet” i jego pryz spotkały się na południowy zachód od Galapagos z rajderem HSK „Atlantis”, zdobytym przez niego statkiem „Silvaplana” oraz statkiem zaopatrzeniowym „Münsterland” płynącym z Jokohamy, z którego „Kota Nopan” uzupełnił paliwo. „Komet” przekazał na „Atlantis” 540 pocisków 150 mm oraz benzynę lotniczą, po czym wraz z „Kota Nopan” wybrał się 24 września w rejs powrotny do Niemiec. 10 października jednostki te opłynęły przylądek Horn.
Powrót do Niemiec i podsumowanie Na Atlantyku „Kota Nopan” odłączył się i 17 listopada zdołał dopłynąć do Bordeaux w okupowanej Francji. „Komet” zamaskowano na portugalski statek „S. Thome”. 8 listopada przekroczył równik płynąc na północ. 17 listopada spotkał się z okrętem podwodnym U-652, a następnie U-561, które eskortowały go do Zatoki Biskajskiej. 26 listopada okręt, zamaskowany na przerywacz zagród minowych Sperrbrecher 52, pomyślnie dotarł do Cherbourga. W eskorcie trałowców i torpedowców przepłynął następnie do Dunkierki, przy tym 28 listopada zespół był atakowany przez brytyjskie ścigacze z Dover (uszkodzony został torpedowiec T 4, jeden marynarz z „Kometa” został ranny). 29 listopada „Komet” był atakowany przez bombowiec Bristol Blenheim, ale jedna 113-kilogramowa bomba, która trafiła okręt, nie wybuchła i wpadła do wody.