W latach 1948–1951 był prorektorem uczelni.
W 1952 roku przeniósł się do Krakowa, gdzie pracował jako profesor filologii romańskiej na Uniwersytecie Jagiellońskim.
Od 24 lipca 1913 był mężem Anny Ludwiki z Pierożyńskich.
Pochowany został na Cmentarzu Salwatorskim w Krakowie (sektor SC3, rząd 1, nr grobu 17).
mały|Grób Anny i Zygmunta Czernych na cmentarzu Salwatorskim
Wybrane publikacje L'esthétique de Louis-Claude De Saint Martin (1920) Współczesna wymowa francuska (1920) O nowy podział materiału neofilologicznego wobec wprowadzenia 8-letniego kursu nauki (1930) O nowy ustrój szkół akademickich (1933) Les aventures de Polo: premier livre de français pour la première classe des écoles secondaires (1934, podręcznik języka francuskiego, wspólnie z Feliksem Jungmanem) Ogólne problemy reformy studjów wyższych w Polsce (1934) Aspects de la France: géographie – histoire – population – institutions – vie économique (1935) Bon sourire et en avant: deuxième livre de français (1935, podręcznik języka francuskiego, wspólnie z Feliksem Jungmanem) O przyszłe liceum ogólnokształcące (1935) Dydaktyka języków nowożytnych (1936) Stan badań literackich we Francji po wojnie (1936) Hier et aujourd'hui: 3-me livre de français pour la 3-me classe des écoles secondaires (1936, podręcznik języka francuskiego, wspólnie z Feliksem