Jarota zajął 12. miejsce i musiał grać baraż o utrzymanie w II lidze. Pokonał BKS Stal Bielsko-Biała i dzięki temu się utrzymał. Kolejne dwa sezony skończył w środku tabeli. Sezon 2011/12 zakończył na 4. miejsce w II lidze, co jak dotąd jest jego najlepszym wynikiem. W sezonie 2013/2014 Jarota spadł do III ligi. Po dziewięciu sezonach rywalizacji na czwartym szczeblu rozgrywkowym klub spadł na piąty poziom, a po kolejnych dwóch - na szósty.
Sezon po sezonie Sezon Liga Pozycja Punkty Bramki Uwagi 2001/02 IV liga, gr. wielkopolska południe4. 51 60:20 2002/03 IV liga, gr. wielkopolska południe2. 80 83:32 2003/04 IV liga, gr. wielkopolska południe1. 84 102:20 przegrany baraż z Lechem II Poznań 2004/05 IV liga, gr. wielkopolska południe2. 64 64:23 2005/06 IV liga, gr. wielkopolska południe1. 69 86:21 wygrany baraż z Nielbą Wągrowiec, awans 2006/07 III liga, gr. II3. 49 50:39 2007/08 III liga, gr. II4. 53 55:27awans do zreformowanej II ligi 2008/09II liga, gr. zachodnia12. 45 51:44 wygrany baraż z BKS Stal Bielsko-Biała 2009/10 II liga, gr. zachodnia7. 48 42:39 2010/11 II liga, gr. zachodnia13. 45 40:34 2011/12 II liga, gr. zachodnia4. 52 41:36 2012/13 II liga, gr. zachodnia10. 44 36:35 2013/14 II liga, gr. zachodnia17. 32 31:56 spadek 2014/15 III liga, gr. kujawsko-pomorsko-wielkopolska10.5243:382015/16III liga, gr.