Janusza Jaguckiego na stanowisku przewodniczącego Komisji Historycznej Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w Rzeczypospolitej Polskiej, której celem jest zbadanie zasobów archiwalnych Instytutu Pamięci Narodowej oraz archiwów wewnątrzkościelnych, dotyczących inwigilacji Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego przez organa bezpieczeństwa państwa w okresie od 22 lipca 1944 do 31 lipca 1990.
Był pracownikiem naukowym ChAT, zajmował się biblistyką w szczególności Nowym Testamentem, znawca języka greckiego i kultury starożytnej. Od 1973 roku był wykładowcą w Katedrze Wiedzy Nowotestamentowej i Języka Greckiego w ChAT. Po śmierci w katastrofie lotniczej 10 kwietnia 2010 ks. Adama Pilcha, tymczasowo przejął po nim obowiązki luterańskiego kapelana Wojska Polskiego oraz proboszcza parafii Ewangelicko-Augsburskiej Wniebowstąpienia Pańskiego w Warszawie.