Formuła 1 W 1993 roku został szefem pogrążonego w konfliktach zespołu Ferrari. Trzy lata później wraz z Michaelem Schumacherem i strategiem Rossem Brawnem miał wyprowadzić stajnię z kryzysu. W ciągu kilku sezonów stworzył zespół inżynierów, który umożliwił Michaelowi Schumacherowi wywalczenie pięciu tytułów mistrzowskich z rzędu w sezonach 2000–2004 i 6 konstruktorskich. W dniu 27 listopada 2007 r. Todt został zastąpiony przez Stefano Domenicaliego na stanowisku dyrektora generalnego Ferrari. Po odejściu Schumachera z F1 pozostał w zespole Scuderii do 17 marca 2009, kiedy to ogłosił odejście z włoskiej stajni.
Fédération Internationale de l’Automobile 23 października 2009 Jean Todt został nowym prezydentem Fédération Internationale de l’Automobile, zastępując na tym stanowisku urzędującego od 1993 roku Maxa Mosleya. W 2021 podczas oficjalnej gali Fédération Internationale de l’Automobile, pożegnano Jeana Todta, który po 12 latach i upływie dwóch kadencji zakończył właśnie pracę w roli prezydenta Fédération Internationale de l’Automobile. Francuz w ramach pożegnalnego prezentu otrzymał gablotę z kaskami wszystkich kierowców rywalizujących w tym sezonie Formuły 1, a także kask z podpisami wszystkich mistrzów świata za jego kadencji.