Alicja Długołęcka, nie zgadzając się z interpretacją Bielik-Robson, stwierdziła, że „odważny język i przerysowane seksualne opisy w jego powieściach [...] mogą stanowić zarówno kalkę, jak i obnażenie obrazów seksu w kulturze masowej”. W opinii Mateusza Burzyka oraz Michała Jędrzejka Houellebecq, choć znajduje sympatię u prawicowych publicystów oraz „knajpianych anarchistów”, dla reszty czytelników okazuje się „pisarzem, który dobitnie i inteligentnie wyraża rozmaite problemy Francji i Europy, nie proponując jednak w pakiecie żadnych pociągających propozycji ich rozwiązania”.
Życie prywatne Po raz pierwszy ożenił się w 1980 r. z kuzynką swojego przyjaciela, jednak wkrótce się rozwiódł. Ma z nią syna. W 1998 roku poślubił swoją drugą żonę, rozwiedli się w 2010 roku. 21 września 2018 po raz trzeci się ożenił. Ślub z Chinką Qianyun Lysis Li odbył się w merostwie 13. dzielnicy Paryża„Michel Houellebecq po raz trzeci na ślubnym kobiercu ”, onet.pl..
Jest agnostykiem. Zmagał się z depresją, alkoholizmem i myślami samobójczymi.
Odznaczenia i wyróżnienia 2017 – Odznaka Honorowa za Naukę i Sztukę (Austria) 2019 – Legia Honorowa (Francja)