Armia egipska stacjonowała w Morei do 1 października 1828, kiedy to po interwencji angielsko-francusko-rosyjskiej dyplomacja egipska zdecydowała się na zawieszenie broni.
Operacje w Morei wyróżniały się szczególnym okrucieństwem. Grecy nie potrafili sprostać zmodernizowanej armii egipsko-tureckiej, toteż w trakcie drugiego oblężenia twierdzy Missolungi (Messolongion) doszło do złamania jej oporu, 24 kwietnia 1826. Na murach wywieszono trzy tysiące ściętych głów – mężczyzn, kobiet i dzieci, część obrońców zdołała jednak przebić się ku wolności. Zdobyto też Ateny. Grecy przeszli do partyzantki, dalej nękając okupantów. Najeźdźcy wyludniali kraj, wysyłając tysiące Greków do Egiptu jako niewolników. Rozmiary represji wciąż rosły, wywołując wielkie oburzenie w Europie, aż pod presją opinii publicznej wysłano do Grecji eskadry okrętów Wielkiej Brytanii, Francji i Rosji. Po zaatakowaniu ich przez flotę turecką bitwa pod Navarino 20 października 1827 zakończyła się rozgromieniem Turków. Rok później Ibrahim Pasza wycofał się z Morei.