W 2006 wygrał konkurs na stanowisko prezesa zarządu Giełdy Papierów Wartościowych w Warszawie (zastąpił na tej funkcji Wiesława Rozłuckiego). W 2010 powołany na drugą kadencję. W trakcie pełnienia tej funkcji w ramach GPW uruchomiono rynek akcji NewConnect w formule alternatywnego systemu obrotu. Obejmował też funkcje członka rad nadzorczych różnych przedsiębiorstw i organizacji finansowych. W 2007 wszedł w skład rady Narodowego Centrum Badań i Rozwoju.
21 grudnia 2012 został zawieszony przez radę nadzorczą w pełnieniu funkcji prezesa zarządu GPW. Nastąpiło to po pojawieniu się m.in. w „Pulsie Biznesu” informacji, jakoby jeden z jego współpracowników lobbował wśród prezesów spółek giełdowych w sprawie sponsoringu filmu Patryka Vegi Zemsta faraona, w którym Anna Szarek (ówczesna partnerka Ludwika Sobolewskiego) miała zagrać jedną z głównych ról. W styczniu 2013 został odwołany ze stanowiska prezesa GPW.
W 2013–2017 był dyrektorem generalnym Giełdy Papierów Wartościowych w Bukareszcie. Był współtwórcą rumuńskiego alternatywnego systemu obrotu AeRO, wzorowanego na polskim rynku akcji NewConnect. Od 2014 do 2015 pełnił też funkcję przewodniczącego rady dyrektorów Poșta Română.