Sześć punktów otrzymuje się za rozwiązanie bezbłędne, pięć za rozwiązanie zawierające jedynie drobne usterki, dwa za pracę zawierającą poważne błędy, ale jednocześnie stanowiącą „istotny postęp w kierunku prawidłowego rozwiązania”, zero punktów za pracę, która nie może otrzymać nawet dwóch. Ten system oceniania jest identyczny ze stosowanym w Olimpiadzie Matematycznej przeznaczonej dla uczniów szkół ponadpodstawowych.
Uprawnienia Uczestnicy finału są dzieleni na: laureatów oraz finalistów. Podział ten jest oparty na wynikach z zawodów III stopnia i pozwala określić kadrę obozów naukowych olimpiady jak i składy na międzynarodowe zawody matematyczne juniorów (np. Czesko-Polsko-Słowackie Zawody Matematyczne Juniorów, w skrócie CPSJ).
Każdy, kto zostanie finalistą lub laureatem OMJ, a więc zakwalifikuje się do zawodów centralnych i przystąpi do nich, otrzymuje od Komitetu Głównego zaświadczenie upoważniające do otrzymania maksymalnej liczby punktów z części matematycznej egzaminu ósmoklasisty oraz umożliwiające dostanie się do dowolnie wybranej przez siebie szkoły ponadpodstawowej.