Podczas służby, uwidoczniły się wady kutrów proj. 664, przede wszystkim mała wytrzymałość kadłubów wykonanych z hydronalium, skutkująca częstymi pęknięciami poszycia i wręg. Okręty często trafiały do stoczni w celu wymiany blach, co zmniejszało liczbę kutrów zdolnych do akcji. Uszkodzeniom sprzyjało uderzanie kadłuba o fale przy dużej szybkości – ORP "Szybki" doznał w ten sposób podczas sztormu uszkodzenia nadbudówki, która uległa częściowemu oderwaniu od pokładu. Problemy zaczęły też sprawiać po pewnym okresie eksploatacji przekładnie sprzęgające ze sobą pary silników wysokoprężnych.
20 kwietnia 1973 doszło w nocy do zderzenia ORP "Sprawny" z trałowcem proj. 206F ORP "Mewa" na wysokości Stilo, po czym wymianie uległa konstrukcja dzioba kutra. W czerwcu 1975 roku sześć jednostek proj. 664 uczestniczyło w ćwiczeniach o kryptonimie Posejdon-75. 17 maja 1985 "Sprawny" zderzył się w Cieśninach Bałtyckich z okrętem rozpoznawczym ORP "Nawigator". W dniach 4–26 maja 1983 roku cztery okręty proj. 664 wzięły udział w wielkich ćwiczeniach sił Marynarki Wojennej o kryptonimie Reda-83.
Na skutek problemów eksploatacyjnych i zużycia, kutry proj. 664 zostały po stosunkowo krótkim okresie służby wycofane w przeciągu lat 80.