W marcu 2018 zaręczyła się z przedsiębiorcą Douglasem Nunesem. Pod koniec lipca 2018 wzięli ślub cywilny, a 4 sierpnia – kościelny. Mają córkę Ashę-Leigh Nunes (ur. 2 listopada 2019). W marcu 2023 Krupa ogłosiła trwającą od 2 stycznia 2023 separację małżeńskąhttps://cozatydzien.tvn.pl/gwiazdy/joanna-krupa-pogodzi-sie-z-mezem-siostra-modelki-komentuje-6876869?source=rss. Rozwód sfinalizowano 4 października 2023https://expressilustrowany.pl/joanna-krupa-jest-juz-po-rozwodzie-zdradza-ile-zarabiala-w-playboyu-modelka-wciaz-zachwyca-uroda-i-seksapilem-zdjecia/ar/c1-17508469#:~:text=Dużo%20ostatnio%20w%20mediach%20Joanny,udało%20się%20uratować%20tego%20związku..
W 2008 wzięła udział w kampanii społecznej Vote No on Prop 8. Equality For All, która sprzeciwiała się wprowadzeniu w amerykańskim stanie Kalifornia poprawki prawnej zamykającej drogę parom jednopłciowym do zawierania małżeństw, tzw.