Na przełomie wieków XV i XVI mieszkańcy wsi studiowali w Krakowie. W latach 1491–1527 odnotowani zostali studenci krakowscy pochodzący z Napachania: w 1492 r. Maciej syn Wojciecha, w 1501 r. Maciej syn Marcina, w 1527 r. Wacław syn Jana. Najbardziej znanym napachańskim studentem krakowskim był późniejszy profesor Uniwersytetu Jagiellońskiego oraz pisarz Antoni z Napachania.
W 1500 roku odnotowano, że Napachanie graniczyło z wsiami należącymi do kapituły katedry poznańskiej: Kobylnikami oraz Kokoszczynem. Kmiecie z Napachania i Chlewisk, wsi panów Szamotulskich, zajmowali bezprawnie role i łąki w Kokoszczynie, a sołtys napachański zaś zajął tamtejszy ostrów. 1509 Napachanie graniczyło z Kobylnikami oraz Tarnowem obecnie Tarnowo Podgórne, wsiami kapituły katedry poznańskiej. Granica oznaczona była kopcami granicznymi, a kmiecie z napachańscy wypasali bydło w zbożu w Kobylnikach. W 1509 na granicy z Kokoszczynem, od strony Napachania, kmiecie i sołtys zagarniali grunty oraz ostrów należący do Piotra Burdy, na którym można było wysiać kilka ćwiertni zboża.