Ten pierwszy polski zakon wziął w posiadanie kościół św. Trójcy (obecny dominikanów), parafia miejska została przeniesiona do kościołów Mariackiego i Wszystkich Świętych. Biskup krakowski Iwo Odrowąż sprowadził cystersów i osadził ich we wsi Mogiła, ufundował również kościół. Powstało tam, istniejące do dziś, opactwo z klasztorem i kościołem. 1223: 12 marca – poświęcono kościół Świętej Trójcy w Krakowie. Z inicjatywy biskupa Iwo Odrowąża, powstała pierwsza w mieście szkoła parafialna. 1225 – Nieudana próba opanowania Krakowa przez Henryka Brodatego. 1227: 24 listopada – zbrodnia gąsawska. Książę Leszek Biały został zamordowany w Gąsawie. 1228: Początek walk o Kraków książąt Konrada mazowieckiego, Władysława Laskonogiego i Henryka Brodatego. Z tytułu opieki nad małoletnim Bolesławem V Wstydliwym władzę przejął Władysław Laskonogi. Osłabiony konfliktem w Wielkopolsce, przekazał rządy Henrykowi Brodatemu. 1229 – Krótkotrwałe opanowanie Krakowa przez Konrada I mazowieckiego. 1230 – Pożar kościoła katedralnego. 1237: Książę Henryk Pobożny sprowadził franciszkanów z Pragi. Doprowadzenie do Krakowa w okolice dzisiejszego klasztoru oo.