Po odbudowaniu asyskich kościołów św. Damiana i św. Piotra Franciszek odnowił kaplicę Porcjunkuli (lata 1206–1208). Życiorys pierwszy podaje jako powód podjętych prac nabożną cześć dla Matki Boskiej. Podczas Eucharystii odprawianej w Porcjunkuli Franciszek usłyszał perykopę o wymogach Królestwa Niebieskiego (Mt 10,7-10). Po mszy poprosił duchownego o jej wyjaśnienie. Następnie uszył dla siebie zgrzebny, szorstki strój w formie krzyża i przepasał się powrozem. Podjął drogę życia radykalnego. W Porcjunkuli przystąpili do Franciszka pierwsi towarzysze, zapoczątkowany został zakon franciszkański. Liczne epizody z życia samego Franciszka jak i pierwszych braci nastąpiły w Porcjunkuli. Zdaniem Bonawentury z Bagnoregio Porcjunkula była miejscem umiłowanym dla Franciszka. Święty zmarł w Porcjunkuli 4 października 1226 roku.
Kopie Kopia kaplicy Porcjunkuli znajduje się w ogrodach Klasztoru Franciszkanów w Waszyngtonie.
W 1987 roku powstała kopia Porcjunkuli przy Uniwersytecie Franciszkańskim w Steubenville w Stanach Zjednoczonych.
Wierna kopia Porcjunkuli znajduje się w ogrodzie zespołu kościelno-klasztornego oo. franciszkanów-reformatów w Wieliczce. Kapliczkę poświęcił 11 czerwca 2000 roku kardynał Franciszek Macharski.
Kardynał William J.