W momencie inauguracji Instytut działał w Willi Decjusza, a po remoncie przeniósł się do budynku przy ulicy Szczepańskiej 1 w Krakowie. W 2015 roku przeprowadził się do zabytkowego budynku kupionego od Radia Kraków przy ulicy Wróblewskiego 6. Warszawska siedziba Instytutu mieści się przy ul. Foksal 17 Biuro w Warszawie.
Z dniem 1 czerwca 2024 Instytut Książki rozpoczął działalność jako nowa państwowa instytucja kultury, w wyniku połączenia dotychczasowego Instytutu Książki i Instytutu Literatury. Dyrektorem został Grzegorz Jankowicz. Funkcje wicedyrektorów objęli Agnieszka Rasińska-Bóbr, Marcin Hamkało i Anna Zagórska.
Program Wśród najważniejszych działań Instytutu Książki należy wymienić programy poświęcone przekładom literatury polskiej na inne języki (Program Translatorski ©Poland, Sample Translations), programy wspierające tłumaczy i tłumaczki literatury polskiej (Kolegium Tłumaczy, Nagroda Transatlantyk, Found in Translation, Stypendium im. Adama Wodnickiego, Stypendium im. Albrechta Lemppa, Stypendium im.