W sezonie 2020 z powodu pandemii COVID-19, kursy tramwaju wodnego nie były realizowane. W 2021 rejsy przewidziano na okres 7 maja - 10 października. Linia „Wschodnia” pozostała zawieszona, a linia „Słoneczna” w związku z zamknięciem szlaku żeglugowego pod Mostem Uniwersyteckim otrzymała czasową trasę Rybi Rynek — Trasa Uniwersytecka — Wyspa Młyńska — Rybi Rynek (45 minut). Od 2022 r. trasa „Słoneczna” została przywrócona w całości z przystankiem w połowie rejsu przy hotelu Słoneczny Młyn, z możliwością zabrania tam pasażerów, którzy wykupią odpowiedni bilet.
Opłaty za przejazd Do końca sezonu żeglugowego 2011 na liniach tramwaju wodnego obowiązywały następujące ceny biletów: bilet normalny – 3,20 zł bilet ulgowy – 1,60 zł przewóz bagażu – 1,60 zł
Od roku 2012 ceny wzrosły i wynosiły:
Na liniach „Słonecznej” i „Staromiejskiej”: bilet normalny – 5,00 zł bilet ulgowy – 2,50 zł Na linii „Szlakiem śluz”: bilet normalny – 8,00 zł bilet ulgowy – 4,00 zł
Wraz z podwyżką cen zniesiono opłaty za bagaż i przyznano ulgę rodzicom podróżującym z dziećmi w wieku od 4 do 16 latUchwała Rady Miasta Bydgoszczy nr XVII/316/11 z 23.11.2011r.